Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6R3

ACSS3, Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS3Q9H6R3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACSS3Q9H6R3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms