Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4M3

FBXO44, F-box only protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO44Q9H4M3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO44Q9H4M3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO44Q9H4M3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO44Q9H4M3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO44Q9H4M3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO44Q9H4M3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO44Q9H4M3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO44Q9H4M3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO44Q9H4M3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO44Q9H4M3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO44Q9H4M3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO44Q9H4M3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO44Q9H4M3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO44Q9H4M3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO44Q9H4M3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO44Q9H4M3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO44Q9H4M3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO44Q9H4M3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms