Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00597Q9H2U6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms