Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms