Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC8Q9H0W5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms