Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SENP6Q9GZR1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SENP6Q9GZR1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SENP6Q9GZR1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SENP6Q9GZR1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SENP6Q9GZR1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SENP6Q9GZR1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SENP6Q9GZR1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SENP6Q9GZR1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SENP6Q9GZR1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SENP6Q9GZR1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SENP6Q9GZR1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SENP6Q9GZR1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SENP6Q9GZR1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SENP6Q9GZR1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SENP6Q9GZR1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SENP6Q9GZR1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SENP6Q9GZR1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SENP6Q9GZR1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SENP6Q9GZR1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SENP6Q9GZR1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SENP6Q9GZR1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SENP6Q9GZR1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SENP6Q9GZR1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SENP6Q9GZR1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SENP6Q9GZR1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SENP6Q9GZR1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SENP6Q9GZR1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SENP6Q9GZR1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SENP6Q9GZR1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SENP6Q9GZR1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SENP6Q9GZR1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SENP6Q9GZR1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SENP6Q9GZR1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SENP6Q9GZR1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SENP6Q9GZR1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SENP6Q9GZR1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SENP6Q9GZR1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SENP6Q9GZR1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SENP6Q9GZR1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SENP6Q9GZR1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms