Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZYG11BQ9C0D3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZYG11BQ9C0D3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZYG11BQ9C0D3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZYG11BQ9C0D3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZYG11BQ9C0D3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZYG11BQ9C0D3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZYG11BQ9C0D3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZYG11BQ9C0D3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZYG11BQ9C0D3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms