Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UPF3BQ9BZI7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UPF3BQ9BZI7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UPF3BQ9BZI7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UPF3BQ9BZI7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UPF3BQ9BZI7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
UPF3BQ9BZI7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms