Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PUS3Q9BZE2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PUS3Q9BZE2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms