Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZB8

CPEB1, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1Q9BZB8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPEB1Q9BZB8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPEB1Q9BZB8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPEB1Q9BZB8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CPEB1Q9BZB8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPEB1Q9BZB8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPEB1Q9BZB8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CPEB1Q9BZB8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPEB1Q9BZB8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPEB1Q9BZB8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CPEB1Q9BZB8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms