Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms