Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLVAPQ9BX97 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLVAPQ9BX97 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLVAPQ9BX97 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLVAPQ9BX97 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLVAPQ9BX97 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLVAPQ9BX97 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLVAPQ9BX97 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLVAPQ9BX97 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLVAPQ9BX97 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLVAPQ9BX97 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLVAPQ9BX97 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLVAPQ9BX97 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLVAPQ9BX97 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLVAPQ9BX97 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLVAPQ9BX97 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLVAPQ9BX97 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLVAPQ9BX97 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLVAPQ9BX97 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLVAPQ9BX97 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PLVAPQ9BX97 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLVAPQ9BX97 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLVAPQ9BX97 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLVAPQ9BX97 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLVAPQ9BX97 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLVAPQ9BX97 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms