Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SYCP2Q9BX26 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms