Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms