Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR3CQ9BUI4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR3CQ9BUI4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR3CQ9BUI4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR3CQ9BUI4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR3CQ9BUI4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR3CQ9BUI4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR3CQ9BUI4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR3CQ9BUI4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR3CQ9BUI4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR3CQ9BUI4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR3CQ9BUI4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR3CQ9BUI4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR3CQ9BUI4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR3CQ9BUI4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR3CQ9BUI4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR3CQ9BUI4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR3CQ9BUI4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR3CQ9BUI4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR3CQ9BUI4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR3CQ9BUI4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR3CQ9BUI4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR3CQ9BUI4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR3CQ9BUI4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR3CQ9BUI4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR3CQ9BUI4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR3CQ9BUI4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR3CQ9BUI4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR3CQ9BUI4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR3CQ9BUI4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR3CQ9BUI4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
POLR3CQ9BUI4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR3CQ9BUI4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms