Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT11Q9BT88 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT11Q9BT88 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT11Q9BT88 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT11Q9BT88 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT11Q9BT88 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT11Q9BT88 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT11Q9BT88 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT11Q9BT88 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT11Q9BT88 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT11Q9BT88 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT11Q9BT88 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT11Q9BT88 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT11Q9BT88 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT11Q9BT88 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT11Q9BT88 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT11Q9BT88 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT11Q9BT88 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT11Q9BT88 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT11Q9BT88 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT11Q9BT88 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT11Q9BT88 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT11Q9BT88 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT11Q9BT88 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT11Q9BT88 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT11Q9BT88 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT11Q9BT88 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT11Q9BT88 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT11Q9BT88 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT11Q9BT88 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT11Q9BT88 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT11Q9BT88 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT11Q9BT88 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT11Q9BT88 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms