Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT09

CNPY3, Protein canopy homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY3Q9BT09 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms