Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PAAF1Q9BRP4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAAF1Q9BRP4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAAF1Q9BRP4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAAF1Q9BRP4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PAAF1Q9BRP4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAAF1Q9BRP4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms