Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms