Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP2Q99959 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP2Q99959 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP2Q99959 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP2Q99959 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP2Q99959 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP2Q99959 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP2Q99959 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP2Q99959 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP2Q99959 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP2Q99959 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP2Q99959 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP2Q99959 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP2Q99959 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP2Q99959 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP2Q99959 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP2Q99959 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP2Q99959 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP2Q99959 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP2Q99959 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP2Q99959 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP2Q99959 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKP2Q99959 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKP2Q99959 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKP2Q99959 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms