Protein–RNA interactions for Protein: Q99502

EYA1, Eyes absent homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA1Q99502 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EYA1Q99502 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EYA1Q99502 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EYA1Q99502 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EYA1Q99502 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EYA1Q99502 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EYA1Q99502 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EYA1Q99502 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
EYA1Q99502 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
EYA1Q99502 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
EYA1Q99502 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EYA1Q99502 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EYA1Q99502 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EYA1Q99502 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EYA1Q99502 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EYA1Q99502 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EYA1Q99502 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
EYA1Q99502 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EYA1Q99502 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EYA1Q99502 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
EYA1Q99502 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EYA1Q99502 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EYA1Q99502 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EYA1Q99502 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EYA1Q99502 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EYA1Q99502 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms