Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms