Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCF12Q99081 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TCF12Q99081 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TCF12Q99081 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TCF12Q99081 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TCF12Q99081 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCF12Q99081 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCF12Q99081 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCF12Q99081 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCF12Q99081 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCF12Q99081 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCF12Q99081 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCF12Q99081 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCF12Q99081 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCF12Q99081 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCF12Q99081 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCF12Q99081 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCF12Q99081 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCF12Q99081 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCF12Q99081 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCF12Q99081 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCF12Q99081 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCF12Q99081 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCF12Q99081 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCF12Q99081 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCF12Q99081 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCF12Q99081 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TCF12Q99081 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCF12Q99081 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCF12Q99081 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCF12Q99081 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCF12Q99081 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCF12Q99081 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms