Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YME1L1Q96TA2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YME1L1Q96TA2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms