Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MMS19Q96T76 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms