Protein–RNA interactions for Protein: Q96SI9

STRBP, Spermatid perinuclear RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRBPQ96SI9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
STRBPQ96SI9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRBPQ96SI9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRBPQ96SI9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRBPQ96SI9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRBPQ96SI9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRBPQ96SI9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRBPQ96SI9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRBPQ96SI9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRBPQ96SI9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRBPQ96SI9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRBPQ96SI9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRBPQ96SI9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRBPQ96SI9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRBPQ96SI9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRBPQ96SI9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRBPQ96SI9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRBPQ96SI9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRBPQ96SI9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
STRBPQ96SI9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRBPQ96SI9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRBPQ96SI9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRBPQ96SI9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRBPQ96SI9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRBPQ96SI9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRBPQ96SI9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRBPQ96SI9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRBPQ96SI9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRBPQ96SI9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRBPQ96SI9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRBPQ96SI9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRBPQ96SI9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRBPQ96SI9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRBPQ96SI9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms