Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS0

TGS1, Trimethylguanosine synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGS1Q96RS0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TGS1Q96RS0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TGS1Q96RS0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms