Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ3

MCCC1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC1Q96RQ3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCCC1Q96RQ3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCCC1Q96RQ3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCCC1Q96RQ3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCCC1Q96RQ3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCCC1Q96RQ3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms