Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CICQ96RK0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms