Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms