Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF488Q96MN9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms