Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK2

RIPOR3, RIPOR family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPOR3Q96MK2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RIPOR3Q96MK2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms