Protein–RNA interactions for Protein: Q96LI5

CNOT6L, CCR4-NOT transcription complex subunit 6-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6LQ96LI5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT6LQ96LI5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT6LQ96LI5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT6LQ96LI5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT6LQ96LI5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT6LQ96LI5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT6LQ96LI5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT6LQ96LI5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT6LQ96LI5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT6LQ96LI5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT6LQ96LI5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT6LQ96LI5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT6LQ96LI5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT6LQ96LI5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT6LQ96LI5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT6LQ96LI5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT6LQ96LI5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT6LQ96LI5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT6LQ96LI5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT6LQ96LI5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT6LQ96LI5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT6LQ96LI5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT6LQ96LI5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT6LQ96LI5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT6LQ96LI5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT6LQ96LI5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT6LQ96LI5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT6LQ96LI5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT6LQ96LI5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT6LQ96LI5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT6LQ96LI5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT6LQ96LI5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT6LQ96LI5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT6LQ96LI5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT6LQ96LI5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT6LQ96LI5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT6LQ96LI5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT6LQ96LI5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT6LQ96LI5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT6LQ96LI5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT6LQ96LI5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT6LQ96LI5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms