Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms