Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC136Q96JN2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms