Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHAMP1Q96JM3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms