Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK5RAP3Q96JB5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms