Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms