Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms