Protein–RNA interactions for Protein: Q96I99

SUCLG2, Succinate--CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2Q96I99 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SUCLG2Q96I99 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SUCLG2Q96I99 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SUCLG2Q96I99 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SUCLG2Q96I99 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SUCLG2Q96I99 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SUCLG2Q96I99 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SUCLG2Q96I99 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SUCLG2Q96I99 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SUCLG2Q96I99 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SUCLG2Q96I99 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SUCLG2Q96I99 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SUCLG2Q96I99 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SUCLG2Q96I99 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SUCLG2Q96I99 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SUCLG2Q96I99 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SUCLG2Q96I99 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SUCLG2Q96I99 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SUCLG2Q96I99 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SUCLG2Q96I99 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SUCLG2Q96I99 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SUCLG2Q96I99 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SUCLG2Q96I99 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SUCLG2Q96I99 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SUCLG2Q96I99 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SUCLG2Q96I99 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SUCLG2Q96I99 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SUCLG2Q96I99 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SUCLG2Q96I99 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SUCLG2Q96I99 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SUCLG2Q96I99 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SUCLG2Q96I99 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SUCLG2Q96I99 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SUCLG2Q96I99 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SUCLG2Q96I99 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SUCLG2Q96I99 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms