Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms