Protein–RNA interactions for Protein: Q96G21

IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4Q96G21 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms