Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms