Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms