Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PGBD4Q96DM1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGBD4Q96DM1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms