Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms