Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms