Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ1

CLUAP1, Clusterin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUAP1Q96AJ1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms