Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TOP1MTQ969P6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms