Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms